2026년 11월 기준으로 정리한 의료비 세액공제 안내다. 올해 병원비·약값·안경값을 꽤 쓴 직장인이라면 12월이 끝나기 전에 내 지출이 공제 문턱을 넘었는지부터 확인해 두는 것이 좋다. 결론부터 말하면 연간 의료비가 총급여의 3%를 넘어야 하고, 넘은 금액의 15%가 세금에서 빠진다.
의료비 세액공제는 근로소득이 있는 사람이 본인과 기본공제대상자를 위해 낸 의료비 일부를 종합소득 산출세액에서 깎아 주는 제도다. 근거는 「소득세법」 제59조의4 제2항과 같은 법 시행령 제118조의5이며, 2026년에 쓴 의료비는 2027년 초 연말정산에서 정산된다.
이 글은 부모님 병원비, 아이 진료비, 안경·보청기 구입비를 함께 쓴 맞벌이·외벌이 가구를 위해 썼다. 공제율과 한도, 빠지는 비용, 계산 예시, 간소화 서비스에서 누락된 영수증을 챙기는 순서까지 차례로 본다.
핵심 요약
- 총급여의 3%를 넘게 쓴 의료비부터 공제되며, 기본 공제율은 15%다.
- 일반 부양가족 의료비는 연 700만 원 한도, 본인·6세 이하·65세 이상·장애인 의료비는 한도가 없다.
- 난임시술비는 30%, 미숙아·선천성이상아 의료비는 20%를 공제한다.
- 안경·콘택트렌즈는 1명당 연 50만 원, 산후조리원은 출산 1회당 200만 원까지만 넣을 수 있다.
의료비 세액공제 대상은 누구인가
의료비 세액공제 대상은 근로소득이 있는 거주자(일용근로자 제외)가 본인과 기본공제대상자를 위해 지출한 의료비다. 국세청 안내에 따르면 이때 기본공제대상자는 나이와 소득 제한을 받지 않으므로, 소득이 있는 부모나 나이 기준을 넘긴 자녀의 의료비도 대상이 될 수 있다.
다만 근로자가 직접 부담한 비용이어야 한다. 회사가 대신 낸 진료비나 실손의료보험으로 돌려받은 금액은 의료비에서 빠진다. 국민건강보험공단에서 받은 본인부담금상한제 사후환급금도 같은 이유로 제외된다.
해가 바뀌기 전에 입사하거나 퇴사한 사람은 근로를 제공한 기간에 쓴 의료비만 공제받는다. 혼인이나 취업으로 연중에 부양가족에서 빠진 가족은 그 사유가 생긴 날까지 낸 의료비만 넣을 수 있다.
의료비 세액공제 한도와 공제율 표
의료비 세액공제율은 15%가 기본이며, 미숙아·선천성이상아는 20%, 난임시술비는 30%로 더 높다. 한도는 누구를 위해 썼는지에 따라 달라지므로 가족별로 영수증을 나눠 보는 것이 첫 단계다.
| 구분 | 공제 대상금액 한도 | 세액공제율 |
|---|---|---|
| 일반 기본공제대상자(배우자·형제자매 등) 의료비 | 연 700만 원 | 15% |
| 본인·6세 이하·65세 이상·장애인·중증질환자 등 의료비 | 한도 없음 | 15% |
| 미숙아·선천성이상아 의료비 | 한도 없음 | 20% |
| 난임시술비(관련 처방 의약품 포함) | 한도 없음 | 30% |
| 시력보정용 안경·콘택트렌즈 | 1명당 연 50만 원 | 15% |
| 산후조리원 비용 | 출산 1회당 200만 원 | 15% |
나이 기준일도 다르다. 6세 이하는 과세기간 개시일(1월 1일) 현재, 65세 이상은 과세기간 종료일(12월 31일) 현재 나이로 본다. 그래서 올해 안에 65세가 되는 부모님 의료비는 한도 없이 계산된다.
공제되는 의료비와 빠지는 비용은 무엇인가
공제되는 의료비는 「소득세법 시행령」 제118조의5에 정해진 항목으로, 의료기관 진료비와 치료용 의약품 구입비가 중심이다. 한약도 치료·요양 목적이면 의약품에 포함된다.
이 밖에 장애인 보장구, 의사·치과의사·한의사 처방에 따라 사거나 빌린 의료기기, 보청기 구입비도 들어간다. 노인장기요양보험 장기요양급여와 장애인활동지원급여의 실제 본인부담금, 산후조리원 비용(출산 1회당 200만 원 이내)도 공제 대상이다.
반대로 미용·성형 수술비와 건강증진용 의약품 구입비는 빠진다. 국세청은 외국 의료기관에 낸 비용과 간병인에게 준 비용도 공제되지 않는다고 안내한다. 영양제나 보약처럼 치료 목적이 아닌 지출은 연말정산 전에 목록에서 미리 빼 두는 편이 안전하다.
의료비 세액공제 신청 순서
의료비 세액공제는 국세청 홈택스의 연말정산 간소화 서비스에서 자료를 내려받아 회사에 제출하는 방식으로 신청한다. 2026년 1월에는 간소화 서비스가 1월 15일에 열렸고, 추가·수정된 최종 확정자료는 1월 20일부터 제공됐다.
- 11~12월에 가족별 진료비·약값·안경 영수증을 모으고, 실손보험금으로 돌려받은 금액을 따로 적어 둔다.
- 부모님·성인 자녀 의료비를 내가 공제받으려면 해당 가족의 자료 제공 동의를 미리 받아 둔다.
- 다음 해 1월 간소화 서비스가 열리면 의료비 자료를 조회하고, 빠진 병원이 있으면 ‘조회되지 않는 의료비 신고센터’에 신고한다(2026년에는 1월 17일까지 접수).
- 안경점·산후조리원처럼 간소화에 없는 지출은 발급기관에서 영수증을 직접 받아 회사에 제출한다.
- 회사 연말정산 화면에 의료비를 입력하고, 실손보험 수령액이 차감됐는지 확인한 뒤 제출한다.
병원비를 실손보험으로 아직 청구하지 않았다면 실손보험 청구기간 2026: 3년 시효와 지난 진료비 확인법도 함께 보면 좋다. 실손으로 받은 금액은 어차피 공제에서 빠지므로, 청구와 연말정산을 같은 시기에 정리하면 중복 입력 실수를 줄일 수 있다.
의료비 세액공제 계산 예시
총급여 5,000만 원인 근로자의 공제 문턱은 150만 원(5,000만 원×3%)이며, 이를 넘긴 금액에 15%를 곱한 값이 세액공제액이다. 아래 두 사례는 「소득세법」 제59조의4의 계산 순서를 그대로 따랐다.
첫째 사례는 본인 100만 원, 65세 이상 부모 200만 원, 배우자 300만 원을 쓴 경우다. 일반 대상인 배우자 의료비 300만 원에서 문턱 150만 원을 빼면 150만 원이 남고, 본인·부모 의료비 300만 원은 한도 없이 더한다. 공제 대상금액 450만 원의 15%인 67만 5천 원이 산출세액에서 빠진다.
둘째 사례는 배우자 50만 원, 본인 200만 원만 쓴 경우다. 일반 의료비 50만 원이 문턱 150만 원에 100만 원 모자라므로, 그 부족분을 본인 의료비에서 뺀다. 남은 100만 원의 15%인 15만 원이 공제액이다. 의료비 합계가 문턱을 넘지 못하면 공제액은 0원이다.
연금계좌 납입처럼 연말 전에 금액을 늘릴 수 있는 다른 공제와 함께 따져 보려면 연금저축펀드 세액공제 2026: 600만·900만원 한도와 계산법과 연말정산 미리보기 2026: 신용카드 공제 계산과 10월 점검법을 참고하면 된다. 남은 두 달 동안 예정된 치료나 안경 교체가 있다면 올해 안에 할지 내년으로 미룰지도 문턱 금액을 기준으로 판단할 수 있다.
의료비 세액공제 주의사항
의료비 세액공제에서 가장 흔한 실수는 실손보험금을 빼지 않고 전액을 입력하는 것이다. 시행령은 보험회사 등에서 받은 실손의료보험금을 의료비에서 제외하도록 정하고 있어, 과다 공제분은 나중에 세금으로 다시 내야 할 수 있다.
맞벌이 부부는 총급여가 낮은 쪽의 3% 문턱이 더 낮다는 점을 고려할 만하지만, 법 조문은 근로자가 직접 지급한 의료비를 공제 대상으로 정하고 있다. 부부 중 누가 결제했는지 카드·계좌 기록을 남겨 두는 것이 좋다.
백내장·다초점 렌즈처럼 비급여 비중이 큰 시술은 실손 청구 기준과 함께 확인해야 한다. 관련 비용 구조는 백내장 수술비용 2026: 단초점·다초점 렌즈 차이와 실손보험 청구 기준에 따로 정리해 두었다. 세법 해석이 애매한 지출은 국세청 국세상담센터에 문의해 확인하는 편이 안전하다.
자주 묻는 질문
Q. 의료비가 총급여의 3%를 넘지 않으면 공제를 못 받나?
못 받는다. 의료비 세액공제는 총급여의 3%를 넘긴 금액부터 계산하므로, 연간 의료비 합계가 그 금액 이하라면 공제액은 0원이다.
Q. 소득이 있는 부모님 병원비도 의료비 세액공제가 되나?
될 수 있다. 국세청은 의료비 세액공제에서 기본공제대상자의 나이와 소득 제한을 적용하지 않는다고 안내하므로, 근로자가 직접 낸 부모님 의료비라면 넣을 수 있다.
Q. 안경 구입비는 얼마까지 의료비 세액공제가 되나?
1명당 연 50만 원까지다. 시력보정용 안경과 콘택트렌즈가 대상이며, 간소화 서비스에 없으면 안경점에서 영수증을 받아 제출한다.
Q. 실손보험금을 받은 진료비도 의료비 세액공제에 넣어도 되나?
넣으면 안 된다. 실손의료보험으로 돌려받은 금액은 의료비에서 제외되므로, 받은 보험금을 뺀 실제 부담액만 입력해야 한다.
Q. 산후조리원 비용은 의료비 세액공제가 얼마까지 되나?
출산 1회당 200만 원까지다. 「모자보건법」에 따른 산후조리원에 낸 산후조리·요양 비용이 대상이다.
출처
- 국세청 의료비·보험료 세액공제(특별세액공제) 안내
- 국가법령정보센터 소득세법 제59조의4(특별세액공제)
- 국가법령정보센터 소득세법 시행령 제118조의5(의료비 세액공제)
- 대한민국 정책브리핑 연말정산 간소화서비스 15일 개통(2026.1.15)
